Из других особенностей Yamaha FJR1300 следует выделить алюминиевую раму, возможность электронной регулировки подвески (AE-версия с 2013 г.), круиз-контроль, электрорегулируемое ветровое стекло, регулировку высоты сиденья, комбинированную тормозную систему с ABS, наличие версий с полуавтоматической КПП (электронное сцепление на версиях AS/AE), систему контроля тяги, 6-ступенчатую КПП (с 2016 года), топливный бак на 25 л, карданный привод и 275 кг снаряженной массы.

''Модель Yamaha FJR1300 выпускается в двух версиях:''

* '''Yamaha FJR1300''' - обычная версия без системы ABS. Была доступна до 2006 года, после чего все модели оснащались комбинированными тормозами с ABS в стандарте.

----

Модель: '''Yamaha FJR13AF / AFC, FJR13ESF/ESFC''' (Северная Америка).