Бутаковка находится в горах [[Заилийский Алатау|Заилийского Алатау]] на территории города [[Алма-Ата|Алма-Аты]], на высоте 1700—2900 м над уровнем моря. По дну ущелья течёт река Бутаковка, являющаяся правым притоком реки Малой Алматинки.